Agé de 35 ans, Neuer avait dû être soigné après un coup à la cheville lors de la victoire du Bayern 3-1 mardi contre le Borussia Dortmund en Supercoupe d'Allemagne.
Il avait toutefois joué les 90 minutes de la rencontre et soulevé le trophée après la victoire du champion sortant de Bundesliga.
Dans un communiqué, le club bavarois a maintenu l'incertitude sur la présence de son gardien dimanche. Il est toujours en attente d'une victoire en championnat après le match nul vendredi dernier à Moenchengladbach (1-1).
Si Neuer ne pouvait pas jouer, il serait remplacé par Sven Ulreich, 33 ans, qui a rejoint le Bayern cet été après une saison à Hambourg (D2 allemande).